Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lrrc58Q3UGP9 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lrrc58Q3UGP9 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lrrc58Q3UGP9 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lrrc58Q3UGP9 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lrrc58Q3UGP9 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lrrc58Q3UGP9 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Lrrc58Q3UGP9 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Lrrc58Q3UGP9 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Lrrc58Q3UGP9 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Lrrc58Q3UGP9 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Lrrc58Q3UGP9 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Lrrc58Q3UGP9 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Lrrc58Q3UGP9 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Lrrc58Q3UGP9 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Lrrc58Q3UGP9 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Lrrc58Q3UGP9 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Lrrc58Q3UGP9 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Lrrc58Q3UGP9 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Lrrc58Q3UGP9 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Lrrc58Q3UGP9 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Lrrc58Q3UGP9 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Lrrc58Q3UGP9 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Lrrc58Q3UGP9 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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