Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnf180Q3U827 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf180Q3U827 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf180Q3U827 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Rnf180Q3U827 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf180Q3U827 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms