Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q3U6N9 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q3U6N9 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q3U6N9 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q3U6N9 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q3U6N9 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
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Q3U6N9 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Q3U6N9 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Q3U6N9 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q3U6N9 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Q3U6N9 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q3U6N9 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q3U6N9 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q3U6N9 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Q3U6N9 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Q3U6N9 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q3U6N9 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q3U6N9 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
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