Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms