Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms