Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hace1Q3U0D9 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hace1Q3U0D9 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms