Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYL0

Putative IQ motif and ankyrin repeat domain-containing protein LOC642574 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TYL0 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TYL0 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TYL0 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TYL0 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TYL0 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TYL0 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TYL0 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TYL0 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TYL0 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TYL0 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TYL0 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TYL0 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TYL0 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TYL0 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TYL0 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TYL0 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TYL0 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TYL0 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TYL0 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TYL0 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TYL0 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TYL0 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TYL0 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TYL0 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TYL0 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TYL0 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TYL0 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TYL0 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TYL0 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TYL0 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3TYL0 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3TYL0 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3TYL0 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3TYL0 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3TYL0 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3TYL0 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3TYL0 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3TYL0 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3TYL0 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3TYL0 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3TYL0 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3TYL0 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3TYL0 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3TYL0 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3TYL0 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3TYL0 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3TYL0 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3TYL0 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3TYL0 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3TYL0 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3TYL0 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3TYL0 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3TYL0 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3TYL0 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3TYL0 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3TYL0 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3TYL0 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q3TYL0 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q3TYL0 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q3TYL0 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q3TYL0 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q3TYL0 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q3TYL0 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q3TYL0 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q3TYL0 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q3TYL0 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q3TYL0 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q3TYL0 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Q3TYL0 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q3TYL0 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3TYL0 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3TYL0 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3TYL0 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3TYL0 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3TYL0 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3TYL0 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3TYL0 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3TYL0 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3TYL0 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3TYL0 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3TYL0 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3TYL0 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3TYL0 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3TYL0 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3TYL0 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3TYL0 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3TYL0 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3TYL0 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3TYL0 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3TYL0 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3TYL0 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3TYL0 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3TYL0 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3TYL0 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3TYL0 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3TYL0 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3TYL0 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3TYL0 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3TYL0 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3TYL0 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms