Protein–RNA interactions for Protein: Q3THW5

H2afv, Histone H2A.V, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afvQ3THW5 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2afvQ3THW5 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms