Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2f1Q3THK3 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2f1Q3THK3 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2f1Q3THK3 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2f1Q3THK3 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2f1Q3THK3 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2f1Q3THK3 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2f1Q3THK3 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2f1Q3THK3 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2f1Q3THK3 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2f1Q3THK3 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2f1Q3THK3 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2f1Q3THK3 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2f1Q3THK3 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2f1Q3THK3 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2f1Q3THK3 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2f1Q3THK3 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2f1Q3THK3 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2f1Q3THK3 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2f1Q3THK3 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2f1Q3THK3 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2f1Q3THK3 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2f1Q3THK3 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2f1Q3THK3 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2f1Q3THK3 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2f1Q3THK3 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2f1Q3THK3 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2f1Q3THK3 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2f1Q3THK3 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2f1Q3THK3 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2f1Q3THK3 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2f1Q3THK3 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2f1Q3THK3 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2f1Q3THK3 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2f1Q3THK3 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2f1Q3THK3 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2f1Q3THK3 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2f1Q3THK3 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2f1Q3THK3 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2f1Q3THK3 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gtf2f1Q3THK3 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gtf2f1Q3THK3 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gtf2f1Q3THK3 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gtf2f1Q3THK3 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2f1Q3THK3 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2f1Q3THK3 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2f1Q3THK3 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2f1Q3THK3 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2f1Q3THK3 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2f1Q3THK3 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2f1Q3THK3 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2f1Q3THK3 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2f1Q3THK3 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2f1Q3THK3 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2f1Q3THK3 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2f1Q3THK3 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2f1Q3THK3 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2f1Q3THK3 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2f1Q3THK3 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2f1Q3THK3 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2f1Q3THK3 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2f1Q3THK3 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2f1Q3THK3 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2f1Q3THK3 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2f1Q3THK3 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2f1Q3THK3 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2f1Q3THK3 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2f1Q3THK3 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2f1Q3THK3 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2f1Q3THK3 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2f1Q3THK3 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2f1Q3THK3 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2f1Q3THK3 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2f1Q3THK3 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2f1Q3THK3 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2f1Q3THK3 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2f1Q3THK3 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2f1Q3THK3 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2f1Q3THK3 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2f1Q3THK3 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2f1Q3THK3 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2f1Q3THK3 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2f1Q3THK3 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2f1Q3THK3 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2f1Q3THK3 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2f1Q3THK3 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2f1Q3THK3 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2f1Q3THK3 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2f1Q3THK3 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2f1Q3THK3 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2f1Q3THK3 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2f1Q3THK3 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2f1Q3THK3 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2f1Q3THK3 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2f1Q3THK3 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2f1Q3THK3 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2f1Q3THK3 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2f1Q3THK3 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2f1Q3THK3 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2f1Q3THK3 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms