Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdgfl1Q2VPR5 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdgfl1Q2VPR5 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdgfl1Q2VPR5 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdgfl1Q2VPR5 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdgfl1Q2VPR5 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdgfl1Q2VPR5 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdgfl1Q2VPR5 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdgfl1Q2VPR5 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdgfl1Q2VPR5 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdgfl1Q2VPR5 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdgfl1Q2VPR5 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdgfl1Q2VPR5 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdgfl1Q2VPR5 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdgfl1Q2VPR5 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdgfl1Q2VPR5 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdgfl1Q2VPR5 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdgfl1Q2VPR5 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdgfl1Q2VPR5 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdgfl1Q2VPR5 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdgfl1Q2VPR5 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdgfl1Q2VPR5 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms