Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Shroom4Q1W617 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Shroom4Q1W617 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Shroom4Q1W617 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Shroom4Q1W617 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Shroom4Q1W617 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Shroom4Q1W617 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Shroom4Q1W617 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Shroom4Q1W617 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Shroom4Q1W617 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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Shroom4Q1W617 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Shroom4Q1W617 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Shroom4Q1W617 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Shroom4Q1W617 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Shroom4Q1W617 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Shroom4Q1W617 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Shroom4Q1W617 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Shroom4Q1W617 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Shroom4Q1W617 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Shroom4Q1W617 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Shroom4Q1W617 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Shroom4Q1W617 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Shroom4Q1W617 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Shroom4Q1W617 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Shroom4Q1W617 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Shroom4Q1W617 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Shroom4Q1W617 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Shroom4Q1W617 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Shroom4Q1W617 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
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Shroom4Q1W617 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Shroom4Q1W617 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Shroom4Q1W617 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Shroom4Q1W617 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Shroom4Q1W617 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
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Shroom4Q1W617 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Shroom4Q1W617 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Shroom4Q1W617 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Shroom4Q1W617 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Shroom4Q1W617 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Shroom4Q1W617 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Shroom4Q1W617 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Shroom4Q1W617 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Shroom4Q1W617 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Shroom4Q1W617 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Shroom4Q1W617 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Shroom4Q1W617 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Shroom4Q1W617 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Shroom4Q1W617 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Shroom4Q1W617 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
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Shroom4Q1W617 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Shroom4Q1W617 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Shroom4Q1W617 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
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Shroom4Q1W617 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Shroom4Q1W617 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Shroom4Q1W617 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Shroom4Q1W617 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Shroom4Q1W617 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Shroom4Q1W617 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Shroom4Q1W617 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Shroom4Q1W617 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Shroom4Q1W617 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Shroom4Q1W617 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
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Shroom4Q1W617 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Shroom4Q1W617 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Shroom4Q1W617 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Shroom4Q1W617 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Shroom4Q1W617 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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Shroom4Q1W617 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Shroom4Q1W617 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Shroom4Q1W617 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Shroom4Q1W617 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Shroom4Q1W617 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
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Shroom4Q1W617 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Shroom4Q1W617 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Shroom4Q1W617 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Shroom4Q1W617 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Shroom4Q1W617 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Shroom4Q1W617 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Shroom4Q1W617 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Shroom4Q1W617 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Shroom4Q1W617 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Shroom4Q1W617 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Shroom4Q1W617 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Shroom4Q1W617 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Shroom4Q1W617 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Shroom4Q1W617 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Shroom4Q1W617 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Shroom4Q1W617 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Shroom4Q1W617 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Shroom4Q1W617 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
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