Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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