Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Rpusd3Q14AI6 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Rpusd3Q14AI6 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
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Rpusd3Q14AI6 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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Rpusd3Q14AI6 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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Rpusd3Q14AI6 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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Rpusd3Q14AI6 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
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Rpusd3Q14AI6 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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Rpusd3Q14AI6 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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Rpusd3Q14AI6 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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Rpusd3Q14AI6 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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Rpusd3Q14AI6 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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Rpusd3Q14AI6 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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Rpusd3Q14AI6 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms