Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Rpusd2Q149F1 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
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Rpusd2Q149F1 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Rpusd2Q149F1 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Rpusd2Q149F1 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Rpusd2Q149F1 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Rpusd2Q149F1 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Rpusd2Q149F1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Rpusd2Q149F1 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Rpusd2Q149F1 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Rpusd2Q149F1 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Rpusd2Q149F1 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Rpusd2Q149F1 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Rpusd2Q149F1 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Rpusd2Q149F1 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms