Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc162pQ0VG85 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms