Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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Ttc39dQ0VF76 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Ttc39dQ0VF76 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Ttc39dQ0VF76 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Ttc39dQ0VF76 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Ttc39dQ0VF76 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Ttc39dQ0VF76 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Ttc39dQ0VF76 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Ttc39dQ0VF76 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Ttc39dQ0VF76 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Ttc39dQ0VF76 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Ttc39dQ0VF76 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Ttc39dQ0VF76 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Ttc39dQ0VF76 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Ttc39dQ0VF76 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Ttc39dQ0VF76 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc39dQ0VF76 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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