Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp2b3Q0VF55 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms