Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.9 ms