Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms