Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms