Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
F13bQ07968 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
F13bQ07968 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
F13bQ07968 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
F13bQ07968 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
F13bQ07968 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
F13bQ07968 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
F13bQ07968 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
F13bQ07968 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
F13bQ07968 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
F13bQ07968 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
F13bQ07968 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
F13bQ07968 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
F13bQ07968 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
F13bQ07968 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
F13bQ07968 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
F13bQ07968 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
F13bQ07968 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
F13bQ07968 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
F13bQ07968 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
F13bQ07968 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
F13bQ07968 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
F13bQ07968 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
F13bQ07968 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
F13bQ07968 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
F13bQ07968 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
F13bQ07968 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
F13bQ07968 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
F13bQ07968 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
F13bQ07968 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
F13bQ07968 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
F13bQ07968 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
F13bQ07968 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
F13bQ07968 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
F13bQ07968 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
F13bQ07968 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
F13bQ07968 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
F13bQ07968 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
F13bQ07968 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
F13bQ07968 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
F13bQ07968 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
F13bQ07968 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
F13bQ07968 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
F13bQ07968 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
F13bQ07968 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
F13bQ07968 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
F13bQ07968 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
F13bQ07968 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
F13bQ07968 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
F13bQ07968 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
F13bQ07968 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
F13bQ07968 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
F13bQ07968 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
F13bQ07968 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
F13bQ07968 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
F13bQ07968 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
F13bQ07968 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
F13bQ07968 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
F13bQ07968 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
F13bQ07968 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
F13bQ07968 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
F13bQ07968 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
F13bQ07968 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
F13bQ07968 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
F13bQ07968 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
F13bQ07968 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
F13bQ07968 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
F13bQ07968 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
F13bQ07968 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
F13bQ07968 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
F13bQ07968 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
F13bQ07968 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
F13bQ07968 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
F13bQ07968 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
F13bQ07968 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
F13bQ07968 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
F13bQ07968 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
F13bQ07968 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
F13bQ07968 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
F13bQ07968 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
F13bQ07968 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
F13bQ07968 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
F13bQ07968 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
F13bQ07968 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
F13bQ07968 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
F13bQ07968 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
F13bQ07968 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
F13bQ07968 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
F13bQ07968 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
F13bQ07968 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
F13bQ07968 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
F13bQ07968 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
F13bQ07968 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
F13bQ07968 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
F13bQ07968 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
F13bQ07968 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
F13bQ07968 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms