Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
NrepQ07475 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NrepQ07475 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NrepQ07475 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NrepQ07475 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
NrepQ07475 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NrepQ07475 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms