Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gdf3Q07104 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gdf3Q07104 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms