Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gm38159-202ENSMUST00000194145 621 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Gm37734-201ENSMUST00000194294 621 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Gm36941-202ENSMUST00000194799 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Gm37378-202ENSMUST00000195795 621 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Gm37130-202ENSMUST00000195874 621 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Olfr489-ps1-201ENSMUST00000210404 967 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 AC153522.1-201ENSMUST00000220047 1090 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Glrb-206ENSMUST00000194085 1341 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Zfp965-202ENSMUST00000109042 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Zfp973-202ENSMUST00000121956 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Gm29664-201ENSMUST00000191125 463 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Olfr1473-ps1-201ENSMUST00000207135 958 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Olfr1112-202ENSMUST00000216772 1443 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Gm45114-201ENSMUST00000208280 1349 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 1700031M16Rik-205ENSMUST00000189907 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Gm37612-201ENSMUST00000193626 582 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 AC129017.2-201ENSMUST00000226118 1284 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Olfr125-201ENSMUST00000050255 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Csn3-201ENSMUST00000001667 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Gm44200-201ENSMUST00000204883 662 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 CT030194.1-201ENSMUST00000225507 532 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 AC154843.1-201ENSMUST00000226897 1138 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms