Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.03■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Smarcad1Q04692 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smarcad1Q04692 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Smarcad1Q04692 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smarcad1Q04692 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smarcad1Q04692 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smarcad1Q04692 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smarcad1Q04692 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms