Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RelaQ04207 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RelaQ04207 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RelaQ04207 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RelaQ04207 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RelaQ04207 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RelaQ04207 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RelaQ04207 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RelaQ04207 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RelaQ04207 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RelaQ04207 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms