Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnb1Q03717 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms