Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scg2Q03517 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms