Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tff2Q03404 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms