Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.7 ms