Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms