Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RykQ01887 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RykQ01887 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RykQ01887 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RykQ01887 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RykQ01887 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RykQ01887 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RykQ01887 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RykQ01887 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RykQ01887 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RykQ01887 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RykQ01887 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RykQ01887 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RykQ01887 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RykQ01887 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RykQ01887 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
RykQ01887 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RykQ01887 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RykQ01887 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RykQ01887 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RykQ01887 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
RykQ01887 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RykQ01887 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RykQ01887 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RykQ01887 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RykQ01887 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
RykQ01887 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RykQ01887 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RykQ01887 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RykQ01887 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RykQ01887 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RykQ01887 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RykQ01887 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RykQ01887 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RykQ01887 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RykQ01887 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RykQ01887 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RykQ01887 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RykQ01887 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RykQ01887 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RykQ01887 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RykQ01887 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RykQ01887 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RykQ01887 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RykQ01887 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RykQ01887 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RykQ01887 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RykQ01887 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RykQ01887 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RykQ01887 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RykQ01887 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RykQ01887 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RykQ01887 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RykQ01887 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RykQ01887 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RykQ01887 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RykQ01887 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RykQ01887 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RykQ01887 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RykQ01887 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RykQ01887 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RykQ01887 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RykQ01887 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RykQ01887 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RykQ01887 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RykQ01887 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RykQ01887 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
RykQ01887 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RykQ01887 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RykQ01887 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RykQ01887 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RykQ01887 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
RykQ01887 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RykQ01887 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RykQ01887 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RykQ01887 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RykQ01887 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RykQ01887 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RykQ01887 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RykQ01887 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
RykQ01887 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RykQ01887 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RykQ01887 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RykQ01887 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
RykQ01887 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RykQ01887 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RykQ01887 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RykQ01887 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RykQ01887 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RykQ01887 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RykQ01887 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RykQ01887 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RykQ01887 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RykQ01887 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RykQ01887 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RykQ01887 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RykQ01887 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RykQ01887 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RykQ01887 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RykQ01887 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.8 ms