Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd1Q01822 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms