Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms