Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms