Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Grin2bQ01097 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Grin2bQ01097 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Grin2bQ01097 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Grin2bQ01097 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Grin2bQ01097 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Grin2bQ01097 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Grin2bQ01097 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Grin2bQ01097 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Grin2bQ01097 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Grin2bQ01097 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Grin2bQ01097 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Grin2bQ01097 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Grin2bQ01097 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Grin2bQ01097 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Grin2bQ01097 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Grin2bQ01097 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Grin2bQ01097 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Grin2bQ01097 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Grin2bQ01097 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Grin2bQ01097 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Grin2bQ01097 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Grin2bQ01097 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Grin2bQ01097 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Grin2bQ01097 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Grin2bQ01097 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Grin2bQ01097 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Grin2bQ01097 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Grin2bQ01097 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Grin2bQ01097 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Grin2bQ01097 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Grin2bQ01097 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Grin2bQ01097 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Grin2bQ01097 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Grin2bQ01097 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Grin2bQ01097 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Grin2bQ01097 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Grin2bQ01097 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Grin2bQ01097 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Grin2bQ01097 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Grin2bQ01097 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Grin2bQ01097 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Grin2bQ01097 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Grin2bQ01097 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Grin2bQ01097 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Grin2bQ01097 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Grin2bQ01097 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Grin2bQ01097 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Grin2bQ01097 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Grin2bQ01097 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Grin2bQ01097 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Grin2bQ01097 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Grin2bQ01097 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Grin2bQ01097 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Grin2bQ01097 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Grin2bQ01097 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Grin2bQ01097 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Grin2bQ01097 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Grin2bQ01097 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Grin2bQ01097 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Grin2bQ01097 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Grin2bQ01097 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Grin2bQ01097 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Grin2bQ01097 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Grin2bQ01097 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Grin2bQ01097 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Grin2bQ01097 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Grin2bQ01097 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Grin2bQ01097 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Grin2bQ01097 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Grin2bQ01097 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Grin2bQ01097 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Grin2bQ01097 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Grin2bQ01097 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Grin2bQ01097 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Grin2bQ01097 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Grin2bQ01097 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Grin2bQ01097 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Grin2bQ01097 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Grin2bQ01097 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Grin2bQ01097 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Grin2bQ01097 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Grin2bQ01097 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Grin2bQ01097 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Grin2bQ01097 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Grin2bQ01097 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Grin2bQ01097 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Grin2bQ01097 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Grin2bQ01097 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Grin2bQ01097 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Grin2bQ01097 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Grin2bQ01097 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Grin2bQ01097 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Grin2bQ01097 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Grin2bQ01097 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Grin2bQ01097 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Grin2bQ01097 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Grin2bQ01097 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Grin2bQ01097 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Grin2bQ01097 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms