Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjb2Q00977 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms