Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms