Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms