Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms