Protein–RNA interactions for Protein: P98195

Atp9b, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, mousemouse

Predictions only

Length 1,146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp9bP98195 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp9bP98195 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms