Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms