Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Mesp1P97309 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mesp1P97309 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms