Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SgcdP82347 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SgcdP82347 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SgcdP82347 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SgcdP82347 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SgcdP82347 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SgcdP82347 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SgcdP82347 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SgcdP82347 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SgcdP82347 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SgcdP82347 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SgcdP82347 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SgcdP82347 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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