Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabpb2P81069 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabpb2P81069 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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