Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cux2P70298 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cux2P70298 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cux2P70298 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cux2P70298 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cux2P70298 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cux2P70298 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cux2P70298 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cux2P70298 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cux2P70298 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cux2P70298 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cux2P70298 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cux2P70298 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms