Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rps3P62908 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rps3P62908 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rps3P62908 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rps3P62908 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rps3P62908 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rps3P62908 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rps3P62908 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rps3P62908 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rps3P62908 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rps3P62908 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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