Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SnrpfP62307 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpfP62307 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpfP62307 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpfP62307 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpfP62307 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpfP62307 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpfP62307 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpfP62307 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpfP62307 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpfP62307 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SnrpfP62307 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SnrpfP62307 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpfP62307 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpfP62307 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpfP62307 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpfP62307 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpfP62307 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SnrpfP62307 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpfP62307 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpfP62307 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpfP62307 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpfP62307 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpfP62307 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpfP62307 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpfP62307 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpfP62307 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpfP62307 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpfP62307 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpfP62307 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpfP62307 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpfP62307 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpfP62307 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpfP62307 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpfP62307 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpfP62307 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpfP62307 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpfP62307 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpfP62307 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpfP62307 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpfP62307 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpfP62307 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpfP62307 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpfP62307 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpfP62307 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpfP62307 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpfP62307 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpfP62307 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SnrpfP62307 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpfP62307 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SnrpfP62307 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SnrpfP62307 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SnrpfP62307 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpfP62307 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpfP62307 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpfP62307 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpfP62307 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpfP62307 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpfP62307 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpfP62307 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpfP62307 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpfP62307 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpfP62307 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SnrpfP62307 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpfP62307 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpfP62307 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpfP62307 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpfP62307 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpfP62307 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpfP62307 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpfP62307 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpfP62307 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpfP62307 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpfP62307 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpfP62307 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpfP62307 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpfP62307 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpfP62307 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SnrpfP62307 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SnrpfP62307 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpfP62307 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpfP62307 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpfP62307 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SnrpfP62307 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpfP62307 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpfP62307 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms