Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps5P59438 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps5P59438 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps5P59438 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps5P59438 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps5P59438 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps5P59438 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps5P59438 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps5P59438 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps5P59438 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps5P59438 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps5P59438 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps5P59438 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps5P59438 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hps5P59438 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.7 ms