Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms